Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NmiO35309 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NmiO35309 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NmiO35309 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NmiO35309 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NmiO35309 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NmiO35309 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NmiO35309 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NmiO35309 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NmiO35309 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NmiO35309 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NmiO35309 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NmiO35309 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NmiO35309 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NmiO35309 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NmiO35309 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NmiO35309 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NmiO35309 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NmiO35309 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NmiO35309 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NmiO35309 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NmiO35309 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NmiO35309 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NmiO35309 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NmiO35309 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NmiO35309 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NmiO35309 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NmiO35309 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NmiO35309 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NmiO35309 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NmiO35309 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NmiO35309 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NmiO35309 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NmiO35309 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NmiO35309 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NmiO35309 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NmiO35309 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NmiO35309 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NmiO35309 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NmiO35309 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NmiO35309 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NmiO35309 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NmiO35309 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NmiO35309 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NmiO35309 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NmiO35309 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NmiO35309 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NmiO35309 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NmiO35309 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NmiO35309 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms