Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn9O35239 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ptpn9O35239 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn9O35239 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn9O35239 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ptpn9O35239 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn9O35239 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn9O35239 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn9O35239 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn9O35239 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ptpn9O35239 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn9O35239 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ptpn9O35239 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn9O35239 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ptpn9O35239 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ptpn9O35239 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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