Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pitx3O35160 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pitx3O35160 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms