Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr1aO35134 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr1aO35134 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms