Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ArxO35085 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ArxO35085 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ArxO35085 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ArxO35085 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ArxO35085 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ArxO35085 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ArxO35085 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ArxO35085 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ArxO35085 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ArxO35085 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ArxO35085 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ArxO35085 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ArxO35085 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ArxO35085 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ArxO35085 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ArxO35085 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ArxO35085 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ArxO35085 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ArxO35085 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ArxO35085 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ArxO35085 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ArxO35085 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ArxO35085 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ArxO35085 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ArxO35085 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ArxO35085 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ArxO35085 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ArxO35085 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ArxO35085 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ArxO35085 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ArxO35085 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ArxO35085 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ArxO35085 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ArxO35085 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ArxO35085 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ArxO35085 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ArxO35085 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ArxO35085 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ArxO35085 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ArxO35085 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ArxO35085 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ArxO35085 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ArxO35085 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ArxO35085 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ArxO35085 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ArxO35085 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ArxO35085 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ArxO35085 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ArxO35085 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ArxO35085 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ArxO35085 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ArxO35085 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ArxO35085 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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