Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn4O35054 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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