Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Casq1O09165 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casq1O09165 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casq1O09165 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Casq1O09165 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Casq1O09165 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Casq1O09165 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Casq1O09165 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms