Protein–RNA interactions for Protein: O09009

Rfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase radical fringe, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfngO09009 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RfngO09009 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RfngO09009 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RfngO09009 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RfngO09009 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfngO09009 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfngO09009 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfngO09009 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RfngO09009 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms