Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms