Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec22bO08547 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sec22bO08547 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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