Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3542K7N6U2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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