Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5225J3QPL3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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