Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21972J3QN38 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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