Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700014D04RikJ3QMS2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms