Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gm3336J3QMQ6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Gm3336J3QMQ6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Gm3336J3QMQ6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3336J3QMQ6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Gm3336J3QMQ6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Gm3336J3QMQ6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Gm3336J3QMQ6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Gm3336J3QMQ6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Gm3336J3QMQ6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Gm3336J3QMQ6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm3336J3QMQ6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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