Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK1

Sgo2b, Shugoshin 2B, mousemouse

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Length 1,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2bJ3QMK1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2bJ3QMK1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2bJ3QMK1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2bJ3QMK1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo2bJ3QMK1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sgo2bJ3QMK1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms