Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calhm3J3QMI4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Calhm3J3QMI4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms