Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm6594J3QM43 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm6594J3QM43 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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