Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn34c3J3QJW5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cldn34c3J3QJW5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cldn34c3J3QJW5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cldn34c3J3QJW5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cldn34c3J3QJW5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cldn34c3J3QJW5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cldn34c3J3QJW5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34c3J3QJW5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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