Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arfip1G5E8V9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms