Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcf11G3X9Z4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcf11G3X9Z4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcf11G3X9Z4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcf11G3X9Z4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms