Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd5G3UW60 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms