Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r76F8VQ63 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms