Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5160F8VPN3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5160F8VPN3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5160F8VPN3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5160F8VPN3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5160F8VPN3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5160F8VPN3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5160F8VPN3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms