Protein–RNA interactions for Protein: F7AEC7

Gm2832, Predicted gene 2832 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2832F7AEC7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm2832F7AEC7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms