Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8444F6XS56 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm8444F6XS56 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms