Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm10378F6XQQ1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms