Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Crocc2F6XLV1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Crocc2F6XLV1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms