Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm17555F6U8B9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm17555F6U8B9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm17555F6U8B9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm17555F6U8B9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm17555F6U8B9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm17555F6U8B9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm17555F6U8B9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm17555F6U8B9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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