Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd7E9Q9W7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd7E9Q9W7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms