Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TrdnE9Q9K5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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TrdnE9Q9K5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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TrdnE9Q9K5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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TrdnE9Q9K5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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TrdnE9Q9K5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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TrdnE9Q9K5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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TrdnE9Q9K5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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TrdnE9Q9K5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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TrdnE9Q9K5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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TrdnE9Q9K5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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TrdnE9Q9K5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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TrdnE9Q9K5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrdnE9Q9K5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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