Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Urb2E9Q7L1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Urb2E9Q7L1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Urb2E9Q7L1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms