Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

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Length 3,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UtrnE9Q6R7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UtrnE9Q6R7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UtrnE9Q6R7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UtrnE9Q6R7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UtrnE9Q6R7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UtrnE9Q6R7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UtrnE9Q6R7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UtrnE9Q6R7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
UtrnE9Q6R7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UtrnE9Q6R7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
UtrnE9Q6R7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UtrnE9Q6R7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UtrnE9Q6R7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UtrnE9Q6R7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms