Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Simc1E9Q6E9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Simc1E9Q6E9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms