Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC051665E9Q623 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BC051665E9Q623 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms