Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nolc1E9Q5C9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms