Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20518E9Q548 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20518E9Q548 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms