Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3020E9Q3J7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms