Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cep350E9Q309 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Cep350E9Q309 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Cep350E9Q309 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Cep350E9Q309 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Cep350E9Q309 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Cep350E9Q309 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Cep350E9Q309 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Cep350E9Q309 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep350E9Q309 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep350E9Q309 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep350E9Q309 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep350E9Q309 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep350E9Q309 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep350E9Q309 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms