Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pdzd2E9Q1M1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms