Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
4930426L09RikE9Q0N7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930426L09RikE9Q0N7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms