Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scaf11E9PZM7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf11E9PZM7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms