Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gcom1E9PZ54 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms