Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rsph10bE9PYQ0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms