Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sfta2E9PXB6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms