Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trappc8E9PWG2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc8E9PWG2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms