Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc62E9PVD1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc62E9PVD1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms