Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syde2E9PUP1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syde2E9PUP1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms