Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Soga1E1U8D0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms