Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC035044E0CXF8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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